A missão da ERENA é contribuir para a conservação da biodiversidade através da promoção do uso sensato dos recursos naturais associado às actividades agrícola, florestal e da gestão da fauna e da flora.
A gestão da biodiversidade implica o domínio de metodologias da sua monitorização e avaliação. A informação fiável e verificável é imprescindível para a tomada de decisão esclarecida sobre os recursos naturais. Estas metodologias destinam-se a conhecer o estado actual, da riqueza em espécies, da abundância e da raridade da fauna, flora e habitat, e a prever a sua evolução em resposta a variações no ambiente.